种瓜选好之后，将种瓜于11月下旬放在5℃-7℃的室内保存，具体方法是用箩筐装沙储藏，即用箩筐装一层沙，放一层瓜，不留空隙，箩筐顶端覆盖10cm~15cm的沙即可。

种瓜应选择个头肥壮、重量500g左右、表皮光滑润薄、腊质多、微黄色、茸毛不明显、芽眼微微突起、无伤疤破损、充分成熟的瓜。不同长势的种株，种瓜成熟期也长短不一，一般在75天左右。

当种瓜长度在80-100厘米，瓜条颜色变为黄白色时即可采收，采收时要带上5厘米长的瓜柄。采收后，把种瓜放置在通风阴凉处自然风干，让其种子慢慢完成后熟过程。

在佛手瓜生长过程中，如果要给佛手瓜留种，就要有意识的选择靠近基部的2～3个果作为种瓜，把其他的摘除，集中养分供养给种瓜。

当留种的佛手瓜颜色稍微转黄时，就要采收，采收以后把佛手瓜剖开，取出里面的种子，把种子进行清洗，然后把种子摊开阴干，装入疏布袋，放在通风干爽处贮存，到第二年进行播种就行。

留种方法：将种瓜蒂部割开5-7cm的深度，把种子取出，将种瓤冲洗干净，并在干燥处晾干。

保存种子：保存温度要在5~7℃之间，可放到缸内或进行沙藏，四周覆盖上煤灰，顶部用稻草覆盖。

佛手瓜可以放置到缸内或者沙壤中进行保存，其种瓜需要挑选个头粗壮，表皮光滑、蜡质较多并且无虫害的成熟瓜，挑选完种瓜后，再对佛手瓜进行处理，将其放置在通风阴凉的环境中风干，等待种瓜慢慢成熟。

佛手瓜留种可以通过缸藏或者沙藏，保存时，需要控制环境的温度处于5-10度之间，然后将装有佛手瓜的容器放置在阴凉通风的环境中，等待初霜到来后，还需要将佛手瓜四周覆盖煤灰和稻草等，为其保暖。